کتاب «چالش سیاست دینی و نظم سلطانی » پیروزی انقلاب اسلامی و شکل گیری نظام جمهوری اسلامی نویدبخش حضور فعال دین در عرصه های سیاسی ـ اجتماعی بود. این ایده در سطح ملی ترسیم کننده هویت دینی ـ ملی و حیات سیاسی ـ اجتماعی ایرانیان و در سطح فراملی تبیین کننده ضرورت بازسازی تمدن اسلامی و اعاده هویت و عزت به مسلمانان در دوران معاصر بود.
بخش های اصلی این کتاب عبارتند از:
بخش اول: مفاهیم و چارچوب نظری
بخش دوم:شرایط ذهنی تکوین اندیشه و عمل سیاسی علمای شیعه
بخش سوم: شرایط عینی تکوین اندیشه و عمل سیاسی علمای شیعه در عصرصفویه
بخش چهارم: فیلسوفان و سیاست در عصر صفویه
بخش پنجم: فقها و سیاست در عصر صفویه